C'est la Lesse, un affluent de la Meuse, qui est à l'origine de ces grottes, par érosion d'une partie de la colline calcaire. La rivière disparaît sous le sol sur une distance d'environ 1 100 mètres (à vol d'oiseau), mais l'eau met 20 heures pour parcourir cette distance.Dans la grotte, la température est plutôt basse tout au long de l'année (13 °C) et on y observe aussi un degré d'humidité élevé.
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